Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CYP4F3Q08477 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CYP4F3Q08477 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CYP4F3Q08477 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CYP4F3Q08477 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CYP4F3Q08477 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CYP4F3Q08477 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CYP4F3Q08477 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CYP4F3Q08477 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CYP4F3Q08477 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CYP4F3Q08477 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CYP4F3Q08477 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CYP4F3Q08477 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CYP4F3Q08477 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CYP4F3Q08477 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CYP4F3Q08477 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CYP4F3Q08477 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CYP4F3Q08477 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CYP4F3Q08477 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CYP4F3Q08477 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CYP4F3Q08477 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CYP4F3Q08477 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CYP4F3Q08477 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CYP4F3Q08477 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CYP4F3Q08477 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CYP4F3Q08477 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CYP4F3Q08477 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CYP4F3Q08477 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CYP4F3Q08477 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CYP4F3Q08477 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CYP4F3Q08477 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CYP4F3Q08477 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CYP4F3Q08477 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CYP4F3Q08477 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CYP4F3Q08477 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CYP4F3Q08477 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CYP4F3Q08477 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CYP4F3Q08477 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CYP4F3Q08477 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CYP4F3Q08477 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CYP4F3Q08477 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CYP4F3Q08477 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CYP4F3Q08477 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CYP4F3Q08477 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CYP4F3Q08477 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CYP4F3Q08477 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CYP4F3Q08477 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CYP4F3Q08477 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CYP4F3Q08477 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CYP4F3Q08477 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CYP4F3Q08477 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CYP4F3Q08477 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CYP4F3Q08477 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CYP4F3Q08477 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CYP4F3Q08477 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CYP4F3Q08477 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CYP4F3Q08477 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CYP4F3Q08477 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CYP4F3Q08477 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CYP4F3Q08477 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CYP4F3Q08477 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CYP4F3Q08477 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CYP4F3Q08477 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CYP4F3Q08477 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CYP4F3Q08477 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CYP4F3Q08477 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CYP4F3Q08477 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CYP4F3Q08477 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CYP4F3Q08477 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CYP4F3Q08477 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CYP4F3Q08477 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CYP4F3Q08477 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CYP4F3Q08477 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CYP4F3Q08477 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CYP4F3Q08477 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CYP4F3Q08477 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CYP4F3Q08477 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CYP4F3Q08477 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CYP4F3Q08477 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CYP4F3Q08477 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CYP4F3Q08477 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CYP4F3Q08477 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CYP4F3Q08477 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CYP4F3Q08477 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CYP4F3Q08477 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CYP4F3Q08477 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CYP4F3Q08477 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CYP4F3Q08477 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CYP4F3Q08477 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CYP4F3Q08477 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CYP4F3Q08477 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CYP4F3Q08477 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CYP4F3Q08477 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CYP4F3Q08477 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CYP4F3Q08477 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CYP4F3Q08477 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CYP4F3Q08477 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CYP4F3Q08477 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CYP4F3Q08477 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CYP4F3Q08477 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms