Protein–RNA interactions for Protein: Q07627

KRTAP1-1, Keratin-associated protein 1-1, humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP1-1Q07627 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms