Protein–RNA interactions for Protein: Q07092

COL16A1, Collagen alpha-1(XVI) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL16A1Q07092 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COL16A1Q07092 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COL16A1Q07092 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
COL16A1Q07092 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COL16A1Q07092 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COL16A1Q07092 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COL16A1Q07092 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
COL16A1Q07092 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
COL16A1Q07092 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
COL16A1Q07092 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
COL16A1Q07092 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
COL16A1Q07092 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COL16A1Q07092 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COL16A1Q07092 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COL16A1Q07092 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COL16A1Q07092 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COL16A1Q07092 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COL16A1Q07092 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COL16A1Q07092 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
COL16A1Q07092 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COL16A1Q07092 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COL16A1Q07092 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
COL16A1Q07092 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COL16A1Q07092 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
COL16A1Q07092 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COL16A1Q07092 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COL16A1Q07092 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COL16A1Q07092 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COL16A1Q07092 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COL16A1Q07092 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COL16A1Q07092 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COL16A1Q07092 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL16A1Q07092 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL16A1Q07092 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL16A1Q07092 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL16A1Q07092 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL16A1Q07092 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL16A1Q07092 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL16A1Q07092 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL16A1Q07092 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL16A1Q07092 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL16A1Q07092 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL16A1Q07092 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL16A1Q07092 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL16A1Q07092 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL16A1Q07092 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL16A1Q07092 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL16A1Q07092 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL16A1Q07092 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
COL16A1Q07092 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL16A1Q07092 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL16A1Q07092 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL16A1Q07092 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
COL16A1Q07092 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL16A1Q07092 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL16A1Q07092 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL16A1Q07092 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL16A1Q07092 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL16A1Q07092 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL16A1Q07092 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL16A1Q07092 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL16A1Q07092 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL16A1Q07092 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL16A1Q07092 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL16A1Q07092 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL16A1Q07092 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL16A1Q07092 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL16A1Q07092 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL16A1Q07092 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
COL16A1Q07092 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL16A1Q07092 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL16A1Q07092 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL16A1Q07092 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL16A1Q07092 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COL16A1Q07092 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COL16A1Q07092 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
COL16A1Q07092 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COL16A1Q07092 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COL16A1Q07092 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
COL16A1Q07092 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COL16A1Q07092 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COL16A1Q07092 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
COL16A1Q07092 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
COL16A1Q07092 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COL16A1Q07092 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COL16A1Q07092 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COL16A1Q07092 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
COL16A1Q07092 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
COL16A1Q07092 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
COL16A1Q07092 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
COL16A1Q07092 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
COL16A1Q07092 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COL16A1Q07092 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
COL16A1Q07092 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
COL16A1Q07092 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
COL16A1Q07092 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COL16A1Q07092 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COL16A1Q07092 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
COL16A1Q07092 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
COL16A1Q07092 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms