Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NUCB1Q02818 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NUCB1Q02818 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NUCB1Q02818 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NUCB1Q02818 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NUCB1Q02818 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NUCB1Q02818 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
NUCB1Q02818 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NUCB1Q02818 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
NUCB1Q02818 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
NUCB1Q02818 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
NUCB1Q02818 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
NUCB1Q02818 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
NUCB1Q02818 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
NUCB1Q02818 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NUCB1Q02818 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
NUCB1Q02818 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
NUCB1Q02818 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
NUCB1Q02818 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
NUCB1Q02818 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
NUCB1Q02818 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
NUCB1Q02818 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
NUCB1Q02818 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
NUCB1Q02818 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NUCB1Q02818 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NUCB1Q02818 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
NUCB1Q02818 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
NUCB1Q02818 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
NUCB1Q02818 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
NUCB1Q02818 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
NUCB1Q02818 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
NUCB1Q02818 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
NUCB1Q02818 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
NUCB1Q02818 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NUCB1Q02818 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NUCB1Q02818 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NUCB1Q02818 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NUCB1Q02818 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NUCB1Q02818 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NUCB1Q02818 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NUCB1Q02818 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NUCB1Q02818 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
NUCB1Q02818 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
NUCB1Q02818 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NUCB1Q02818 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NUCB1Q02818 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NUCB1Q02818 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NUCB1Q02818 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NUCB1Q02818 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NUCB1Q02818 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NUCB1Q02818 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
NUCB1Q02818 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
NUCB1Q02818 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
NUCB1Q02818 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NUCB1Q02818 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NUCB1Q02818 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NUCB1Q02818 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NUCB1Q02818 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NUCB1Q02818 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NUCB1Q02818 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NUCB1Q02818 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NUCB1Q02818 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NUCB1Q02818 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NUCB1Q02818 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NUCB1Q02818 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
NUCB1Q02818 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NUCB1Q02818 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NUCB1Q02818 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NUCB1Q02818 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NUCB1Q02818 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NUCB1Q02818 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NUCB1Q02818 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
NUCB1Q02818 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NUCB1Q02818 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NUCB1Q02818 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NUCB1Q02818 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NUCB1Q02818 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NUCB1Q02818 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NUCB1Q02818 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NUCB1Q02818 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NUCB1Q02818 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NUCB1Q02818 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NUCB1Q02818 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NUCB1Q02818 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NUCB1Q02818 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NUCB1Q02818 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NUCB1Q02818 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NUCB1Q02818 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NUCB1Q02818 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NUCB1Q02818 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NUCB1Q02818 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NUCB1Q02818 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NUCB1Q02818 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NUCB1Q02818 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NUCB1Q02818 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NUCB1Q02818 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NUCB1Q02818 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NUCB1Q02818 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NUCB1Q02818 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NUCB1Q02818 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms