Protein–RNA interactions for Protein: Q01954

BNC1, Zinc finger protein basonuclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC1Q01954 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.2 ms