Protein–RNA interactions for Protein: Q00975

CACNA1B, Voltage-dependent N-type calcium channel subunit alpha-1B, humanhuman

Predictions only

Length 2,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1BQ00975 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNA1BQ00975 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNA1BQ00975 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNA1BQ00975 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNA1BQ00975 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNA1BQ00975 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNA1BQ00975 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNA1BQ00975 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNA1BQ00975 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNA1BQ00975 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNA1BQ00975 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNA1BQ00975 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNA1BQ00975 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNA1BQ00975 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNA1BQ00975 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNA1BQ00975 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNA1BQ00975 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNA1BQ00975 LINC00470-210ENST00000584090 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNA1BQ00975 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNA1BQ00975 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNA1BQ00975 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNA1BQ00975 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNA1BQ00975 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNA1BQ00975 AL365436.2-201ENST00000434112 526 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNA1BQ00975 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNA1BQ00975 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNA1BQ00975 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNA1BQ00975 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNA1BQ00975 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNA1BQ00975 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNA1BQ00975 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNA1BQ00975 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CACNA1BQ00975 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CACNA1BQ00975 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CACNA1BQ00975 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CACNA1BQ00975 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CACNA1BQ00975 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CACNA1BQ00975 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CACNA1BQ00975 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CACNA1BQ00975 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CACNA1BQ00975 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CACNA1BQ00975 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CACNA1BQ00975 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CACNA1BQ00975 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CACNA1BQ00975 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CACNA1BQ00975 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CACNA1BQ00975 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CACNA1BQ00975 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CACNA1BQ00975 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CACNA1BQ00975 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CACNA1BQ00975 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CACNA1BQ00975 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CACNA1BQ00975 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CACNA1BQ00975 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CACNA1BQ00975 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CACNA1BQ00975 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CACNA1BQ00975 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CACNA1BQ00975 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CACNA1BQ00975 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CACNA1BQ00975 AP003392.6-201ENST00000607709 325 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CACNA1BQ00975 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CACNA1BQ00975 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CACNA1BQ00975 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CACNA1BQ00975 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CACNA1BQ00975 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CACNA1BQ00975 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CACNA1BQ00975 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CACNA1BQ00975 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CACNA1BQ00975 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CACNA1BQ00975 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CACNA1BQ00975 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CACNA1BQ00975 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CACNA1BQ00975 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CACNA1BQ00975 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CACNA1BQ00975 PPOX-204ENST00000462866 473 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CACNA1BQ00975 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CACNA1BQ00975 MPZL3-203ENST00000525386 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CACNA1BQ00975 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CACNA1BQ00975 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CACNA1BQ00975 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CACNA1BQ00975 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CACNA1BQ00975 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CACNA1BQ00975 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CACNA1BQ00975 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CACNA1BQ00975 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CACNA1BQ00975 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CACNA1BQ00975 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CACNA1BQ00975 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CACNA1BQ00975 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CACNA1BQ00975 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CACNA1BQ00975 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
CACNA1BQ00975 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNA1BQ00975 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNA1BQ00975 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNA1BQ00975 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNA1BQ00975 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNA1BQ00975 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNA1BQ00975 TCERG1L-AS1-201ENST00000436942 472 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNA1BQ00975 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNA1BQ00975 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms