Protein–RNA interactions for Protein: Q00534

CDK6, Cyclin-dependent kinase 6, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK6Q00534 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDK6Q00534 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDK6Q00534 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDK6Q00534 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDK6Q00534 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDK6Q00534 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDK6Q00534 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDK6Q00534 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDK6Q00534 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDK6Q00534 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDK6Q00534 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDK6Q00534 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CDK6Q00534 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDK6Q00534 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDK6Q00534 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDK6Q00534 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDK6Q00534 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDK6Q00534 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CDK6Q00534 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDK6Q00534 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDK6Q00534 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDK6Q00534 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDK6Q00534 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDK6Q00534 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDK6Q00534 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDK6Q00534 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDK6Q00534 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDK6Q00534 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDK6Q00534 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CDK6Q00534 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms