Protein–RNA interactions for Protein: Q00266

MAT1A, S-adenosylmethionine synthase isoform type-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAT1AQ00266 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MAT1AQ00266 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MAT1AQ00266 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MAT1AQ00266 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
MAT1AQ00266 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MAT1AQ00266 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MAT1AQ00266 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MAT1AQ00266 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MAT1AQ00266 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MAT1AQ00266 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MAT1AQ00266 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
MAT1AQ00266 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MAT1AQ00266 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MAT1AQ00266 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MAT1AQ00266 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MAT1AQ00266 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MAT1AQ00266 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MAT1AQ00266 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MAT1AQ00266 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MAT1AQ00266 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MAT1AQ00266 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MAT1AQ00266 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAT1AQ00266 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAT1AQ00266 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAT1AQ00266 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAT1AQ00266 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAT1AQ00266 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAT1AQ00266 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAT1AQ00266 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAT1AQ00266 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAT1AQ00266 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAT1AQ00266 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAT1AQ00266 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAT1AQ00266 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAT1AQ00266 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAT1AQ00266 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAT1AQ00266 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAT1AQ00266 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAT1AQ00266 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAT1AQ00266 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAT1AQ00266 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAT1AQ00266 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
MAT1AQ00266 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAT1AQ00266 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAT1AQ00266 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAT1AQ00266 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAT1AQ00266 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAT1AQ00266 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAT1AQ00266 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
MAT1AQ00266 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAT1AQ00266 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAT1AQ00266 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAT1AQ00266 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAT1AQ00266 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAT1AQ00266 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAT1AQ00266 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAT1AQ00266 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAT1AQ00266 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAT1AQ00266 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MAT1AQ00266 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MAT1AQ00266 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MAT1AQ00266 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MAT1AQ00266 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MAT1AQ00266 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MAT1AQ00266 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MAT1AQ00266 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MAT1AQ00266 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MAT1AQ00266 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MAT1AQ00266 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MAT1AQ00266 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MAT1AQ00266 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MAT1AQ00266 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MAT1AQ00266 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MAT1AQ00266 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MAT1AQ00266 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MAT1AQ00266 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MAT1AQ00266 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MAT1AQ00266 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MAT1AQ00266 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
MAT1AQ00266 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MAT1AQ00266 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MAT1AQ00266 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MAT1AQ00266 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
MAT1AQ00266 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MAT1AQ00266 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MAT1AQ00266 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
MAT1AQ00266 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MAT1AQ00266 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MAT1AQ00266 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MAT1AQ00266 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MAT1AQ00266 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MAT1AQ00266 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MAT1AQ00266 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
MAT1AQ00266 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
MAT1AQ00266 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MAT1AQ00266 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MAT1AQ00266 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MAT1AQ00266 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
MAT1AQ00266 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MAT1AQ00266 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.1 ms