Protein–RNA interactions for Protein: P98172

EFNB1, Ephrin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB1P98172 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EFNB1P98172 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
EFNB1P98172 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EFNB1P98172 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EFNB1P98172 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EFNB1P98172 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EFNB1P98172 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EFNB1P98172 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EFNB1P98172 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EFNB1P98172 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EFNB1P98172 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EFNB1P98172 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EFNB1P98172 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EFNB1P98172 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EFNB1P98172 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EFNB1P98172 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EFNB1P98172 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EFNB1P98172 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EFNB1P98172 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EFNB1P98172 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EFNB1P98172 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EFNB1P98172 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EFNB1P98172 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EFNB1P98172 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EFNB1P98172 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EFNB1P98172 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
EFNB1P98172 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
EFNB1P98172 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
EFNB1P98172 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EFNB1P98172 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EFNB1P98172 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EFNB1P98172 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EFNB1P98172 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
EFNB1P98172 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EFNB1P98172 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EFNB1P98172 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EFNB1P98172 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EFNB1P98172 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EFNB1P98172 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EFNB1P98172 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EFNB1P98172 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EFNB1P98172 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EFNB1P98172 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EFNB1P98172 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EFNB1P98172 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EFNB1P98172 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EFNB1P98172 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EFNB1P98172 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EFNB1P98172 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EFNB1P98172 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EFNB1P98172 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EFNB1P98172 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EFNB1P98172 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFNB1P98172 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFNB1P98172 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFNB1P98172 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
EFNB1P98172 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFNB1P98172 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
EFNB1P98172 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFNB1P98172 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFNB1P98172 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFNB1P98172 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFNB1P98172 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFNB1P98172 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFNB1P98172 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFNB1P98172 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
EFNB1P98172 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFNB1P98172 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFNB1P98172 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFNB1P98172 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFNB1P98172 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFNB1P98172 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFNB1P98172 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFNB1P98172 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFNB1P98172 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFNB1P98172 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFNB1P98172 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFNB1P98172 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFNB1P98172 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFNB1P98172 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
EFNB1P98172 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFNB1P98172 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFNB1P98172 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFNB1P98172 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFNB1P98172 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFNB1P98172 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFNB1P98172 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFNB1P98172 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFNB1P98172 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFNB1P98172 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFNB1P98172 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFNB1P98172 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFNB1P98172 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFNB1P98172 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFNB1P98172 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFNB1P98172 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFNB1P98172 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFNB1P98172 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFNB1P98172 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFNB1P98172 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms