Protein–RNA interactions for Protein: P78337

PITX1, Pituitary homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1P78337 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PITX1P78337 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PITX1P78337 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
PITX1P78337 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PITX1P78337 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PITX1P78337 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PITX1P78337 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PITX1P78337 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PITX1P78337 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PITX1P78337 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PITX1P78337 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PITX1P78337 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PITX1P78337 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PITX1P78337 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PITX1P78337 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PITX1P78337 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PITX1P78337 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PITX1P78337 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PITX1P78337 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PITX1P78337 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PITX1P78337 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PITX1P78337 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PITX1P78337 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PITX1P78337 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PITX1P78337 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PITX1P78337 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PITX1P78337 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PITX1P78337 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PITX1P78337 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PITX1P78337 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PITX1P78337 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PITX1P78337 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PITX1P78337 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PITX1P78337 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PITX1P78337 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PITX1P78337 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PITX1P78337 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PITX1P78337 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PITX1P78337 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PITX1P78337 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PITX1P78337 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PITX1P78337 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PITX1P78337 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PITX1P78337 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PITX1P78337 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PITX1P78337 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
PITX1P78337 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PITX1P78337 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PITX1P78337 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
PITX1P78337 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
PITX1P78337 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PITX1P78337 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PITX1P78337 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PITX1P78337 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PITX1P78337 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PITX1P78337 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PITX1P78337 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PITX1P78337 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PITX1P78337 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PITX1P78337 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PITX1P78337 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PITX1P78337 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PITX1P78337 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PITX1P78337 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PITX1P78337 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PITX1P78337 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PITX1P78337 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PITX1P78337 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PITX1P78337 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PITX1P78337 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
PITX1P78337 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PITX1P78337 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PITX1P78337 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PITX1P78337 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PITX1P78337 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PITX1P78337 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PITX1P78337 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PITX1P78337 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PITX1P78337 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PITX1P78337 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PITX1P78337 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PITX1P78337 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
PITX1P78337 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PITX1P78337 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PITX1P78337 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PITX1P78337 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PITX1P78337 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
PITX1P78337 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PITX1P78337 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PITX1P78337 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PITX1P78337 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PITX1P78337 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PITX1P78337 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PITX1P78337 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PITX1P78337 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PITX1P78337 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PITX1P78337 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
PITX1P78337 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PITX1P78337 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PITX1P78337 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms