Protein–RNA interactions for Protein: P68871

HBB, Hemoglobin subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBBP68871 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
HBBP68871 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
HBBP68871 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
HBBP68871 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
HBBP68871 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
HBBP68871 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
HBBP68871 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
HBBP68871 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
HBBP68871 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
HBBP68871 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
HBBP68871 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
HBBP68871 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
HBBP68871 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
HBBP68871 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
HBBP68871 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
HBBP68871 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
HBBP68871 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
HBBP68871 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
HBBP68871 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
HBBP68871 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
HBBP68871 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
HBBP68871 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
HBBP68871 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
HBBP68871 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
HBBP68871 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
HBBP68871 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
HBBP68871 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
HBBP68871 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
HBBP68871 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
HBBP68871 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
HBBP68871 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
HBBP68871 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
HBBP68871 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
HBBP68871 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
HBBP68871 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
HBBP68871 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
HBBP68871 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
HBBP68871 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
HBBP68871 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
HBBP68871 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
HBBP68871 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
HBBP68871 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
HBBP68871 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
HBBP68871 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
HBBP68871 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
HBBP68871 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
HBBP68871 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
HBBP68871 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
HBBP68871 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
HBBP68871 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
HBBP68871 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
HBBP68871 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
HBBP68871 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
HBBP68871 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
HBBP68871 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
HBBP68871 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
HBBP68871 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
HBBP68871 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
HBBP68871 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
HBBP68871 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
HBBP68871 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
HBBP68871 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
HBBP68871 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
HBBP68871 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
HBBP68871 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
HBBP68871 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
HBBP68871 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
HBBP68871 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
HBBP68871 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
HBBP68871 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
HBBP68871 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
HBBP68871 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
HBBP68871 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
HBBP68871 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
HBBP68871 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
HBBP68871 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
HBBP68871 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
HBBP68871 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
HBBP68871 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
HBBP68871 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
HBBP68871 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
HBBP68871 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
HBBP68871 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
HBBP68871 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
HBBP68871 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
HBBP68871 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
HBBP68871 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
HBBP68871 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
HBBP68871 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
HBBP68871 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
HBBP68871 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
HBBP68871 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
HBBP68871 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
HBBP68871 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
HBBP68871 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
HBBP68871 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
HBBP68871 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
HBBP68871 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
HBBP68871 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
HBBP68871 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms