Protein–RNA interactions for Protein: P61204

ARF3, ADP-ribosylation factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF3P61204 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARF3P61204 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARF3P61204 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARF3P61204 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ARF3P61204 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARF3P61204 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARF3P61204 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARF3P61204 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARF3P61204 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARF3P61204 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARF3P61204 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARF3P61204 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARF3P61204 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARF3P61204 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARF3P61204 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARF3P61204 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARF3P61204 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARF3P61204 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARF3P61204 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARF3P61204 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARF3P61204 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARF3P61204 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARF3P61204 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARF3P61204 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARF3P61204 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARF3P61204 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARF3P61204 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARF3P61204 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARF3P61204 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARF3P61204 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARF3P61204 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARF3P61204 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARF3P61204 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARF3P61204 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARF3P61204 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARF3P61204 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARF3P61204 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARF3P61204 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARF3P61204 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARF3P61204 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARF3P61204 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ARF3P61204 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARF3P61204 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARF3P61204 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ARF3P61204 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARF3P61204 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARF3P61204 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARF3P61204 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARF3P61204 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARF3P61204 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARF3P61204 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARF3P61204 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARF3P61204 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARF3P61204 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARF3P61204 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARF3P61204 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARF3P61204 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARF3P61204 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARF3P61204 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARF3P61204 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARF3P61204 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ARF3P61204 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARF3P61204 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARF3P61204 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARF3P61204 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARF3P61204 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ARF3P61204 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARF3P61204 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARF3P61204 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARF3P61204 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARF3P61204 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARF3P61204 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARF3P61204 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARF3P61204 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARF3P61204 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARF3P61204 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARF3P61204 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARF3P61204 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARF3P61204 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARF3P61204 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARF3P61204 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARF3P61204 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARF3P61204 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARF3P61204 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARF3P61204 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARF3P61204 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARF3P61204 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARF3P61204 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ARF3P61204 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARF3P61204 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARF3P61204 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARF3P61204 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARF3P61204 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARF3P61204 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARF3P61204 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ARF3P61204 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARF3P61204 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ARF3P61204 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARF3P61204 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ARF3P61204 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms