Protein–RNA interactions for Protein: P59942

MCCD1, Mitochondrial coiled-coil domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCD1P59942 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MCCD1P59942 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MCCD1P59942 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
MCCD1P59942 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
MCCD1P59942 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MCCD1P59942 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
MCCD1P59942 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MCCD1P59942 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MCCD1P59942 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
MCCD1P59942 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
MCCD1P59942 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MCCD1P59942 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MCCD1P59942 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
MCCD1P59942 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MCCD1P59942 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MCCD1P59942 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCCD1P59942 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCCD1P59942 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCCD1P59942 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCCD1P59942 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCCD1P59942 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCCD1P59942 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCCD1P59942 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCCD1P59942 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCCD1P59942 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCCD1P59942 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCCD1P59942 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCCD1P59942 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
MCCD1P59942 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
MCCD1P59942 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCCD1P59942 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCCD1P59942 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
MCCD1P59942 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCCD1P59942 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCCD1P59942 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
MCCD1P59942 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCCD1P59942 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
MCCD1P59942 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCCD1P59942 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCCD1P59942 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCCD1P59942 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCCD1P59942 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCCD1P59942 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCCD1P59942 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCCD1P59942 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
MCCD1P59942 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCCD1P59942 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCCD1P59942 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCCD1P59942 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCCD1P59942 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MCCD1P59942 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MCCD1P59942 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MCCD1P59942 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MCCD1P59942 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MCCD1P59942 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MCCD1P59942 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MCCD1P59942 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MCCD1P59942 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MCCD1P59942 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC18■□□□□ 0.47
MCCD1P59942 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MCCD1P59942 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MCCD1P59942 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MCCD1P59942 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MCCD1P59942 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC18■□□□□ 0.47
MCCD1P59942 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MCCD1P59942 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MCCD1P59942 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC18■□□□□ 0.47
MCCD1P59942 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MCCD1P59942 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
MCCD1P59942 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MCCD1P59942 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC18■□□□□ 0.47
MCCD1P59942 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MCCD1P59942 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MCCD1P59942 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MCCD1P59942 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MCCD1P59942 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MCCD1P59942 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MCCD1P59942 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MCCD1P59942 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MCCD1P59942 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MCCD1P59942 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MCCD1P59942 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MCCD1P59942 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MCCD1P59942 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MCCD1P59942 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MCCD1P59942 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MCCD1P59942 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MCCD1P59942 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MCCD1P59942 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MCCD1P59942 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MCCD1P59942 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MCCD1P59942 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MCCD1P59942 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MCCD1P59942 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MCCD1P59942 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MCCD1P59942 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
MCCD1P59942 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MCCD1P59942 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MCCD1P59942 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MCCD1P59942 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms