Protein–RNA interactions for Protein: P55822

SH3BGR, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRP55822 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SH3BGRP55822 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SH3BGRP55822 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SH3BGRP55822 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SH3BGRP55822 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SH3BGRP55822 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SH3BGRP55822 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SH3BGRP55822 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SH3BGRP55822 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SH3BGRP55822 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SH3BGRP55822 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SH3BGRP55822 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SH3BGRP55822 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SH3BGRP55822 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SH3BGRP55822 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SH3BGRP55822 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SH3BGRP55822 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SH3BGRP55822 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SH3BGRP55822 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SH3BGRP55822 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SH3BGRP55822 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SH3BGRP55822 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SH3BGRP55822 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SH3BGRP55822 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SH3BGRP55822 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SH3BGRP55822 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SH3BGRP55822 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SH3BGRP55822 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SH3BGRP55822 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SH3BGRP55822 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SH3BGRP55822 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SH3BGRP55822 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SH3BGRP55822 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SH3BGRP55822 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SH3BGRP55822 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SH3BGRP55822 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SH3BGRP55822 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SH3BGRP55822 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SH3BGRP55822 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SH3BGRP55822 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SH3BGRP55822 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SH3BGRP55822 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SH3BGRP55822 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SH3BGRP55822 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SH3BGRP55822 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SH3BGRP55822 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SH3BGRP55822 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SH3BGRP55822 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SH3BGRP55822 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SH3BGRP55822 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SH3BGRP55822 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SH3BGRP55822 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SH3BGRP55822 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SH3BGRP55822 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SH3BGRP55822 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SH3BGRP55822 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SH3BGRP55822 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SH3BGRP55822 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SH3BGRP55822 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SH3BGRP55822 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SH3BGRP55822 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SH3BGRP55822 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SH3BGRP55822 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SH3BGRP55822 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SH3BGRP55822 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SH3BGRP55822 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SH3BGRP55822 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SH3BGRP55822 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SH3BGRP55822 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SH3BGRP55822 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SH3BGRP55822 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SH3BGRP55822 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SH3BGRP55822 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SH3BGRP55822 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SH3BGRP55822 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SH3BGRP55822 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SH3BGRP55822 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SH3BGRP55822 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SH3BGRP55822 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SH3BGRP55822 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SH3BGRP55822 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SH3BGRP55822 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SH3BGRP55822 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SH3BGRP55822 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SH3BGRP55822 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SH3BGRP55822 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SH3BGRP55822 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SH3BGRP55822 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SH3BGRP55822 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SH3BGRP55822 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SH3BGRP55822 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SH3BGRP55822 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SH3BGRP55822 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SH3BGRP55822 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SH3BGRP55822 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SH3BGRP55822 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SH3BGRP55822 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SH3BGRP55822 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SH3BGRP55822 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SH3BGRP55822 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms