Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAD23AP54725 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAD23AP54725 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAD23AP54725 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAD23AP54725 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAD23AP54725 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAD23AP54725 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAD23AP54725 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
RAD23AP54725 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAD23AP54725 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAD23AP54725 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
RAD23AP54725 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAD23AP54725 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAD23AP54725 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAD23AP54725 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAD23AP54725 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAD23AP54725 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
RAD23AP54725 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAD23AP54725 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAD23AP54725 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAD23AP54725 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms