Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SMARCA2P51531 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
SMARCA2P51531 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SMARCA2P51531 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SMARCA2P51531 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SMARCA2P51531 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SMARCA2P51531 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SMARCA2P51531 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
SMARCA2P51531 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SMARCA2P51531 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SMARCA2P51531 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
SMARCA2P51531 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SMARCA2P51531 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
SMARCA2P51531 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SMARCA2P51531 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SMARCA2P51531 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SMARCA2P51531 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SMARCA2P51531 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SMARCA2P51531 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SMARCA2P51531 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SMARCA2P51531 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SMARCA2P51531 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SMARCA2P51531 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SMARCA2P51531 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SMARCA2P51531 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SMARCA2P51531 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SMARCA2P51531 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SMARCA2P51531 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
SMARCA2P51531 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
SMARCA2P51531 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
SMARCA2P51531 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
SMARCA2P51531 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC29.51■■■□□ 2.31
SMARCA2P51531 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
SMARCA2P51531 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
SMARCA2P51531 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SMARCA2P51531 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
SMARCA2P51531 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
SMARCA2P51531 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
SMARCA2P51531 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SMARCA2P51531 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SMARCA2P51531 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SMARCA2P51531 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SMARCA2P51531 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SMARCA2P51531 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SMARCA2P51531 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SMARCA2P51531 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SMARCA2P51531 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SMARCA2P51531 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SMARCA2P51531 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SMARCA2P51531 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SMARCA2P51531 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SMARCA2P51531 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SMARCA2P51531 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SMARCA2P51531 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SMARCA2P51531 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SMARCA2P51531 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SMARCA2P51531 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SMARCA2P51531 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
SMARCA2P51531 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SMARCA2P51531 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SMARCA2P51531 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SMARCA2P51531 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SMARCA2P51531 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SMARCA2P51531 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SMARCA2P51531 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SMARCA2P51531 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SMARCA2P51531 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SMARCA2P51531 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SMARCA2P51531 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SMARCA2P51531 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SMARCA2P51531 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
SMARCA2P51531 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SMARCA2P51531 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SMARCA2P51531 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SMARCA2P51531 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SMARCA2P51531 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SMARCA2P51531 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SMARCA2P51531 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SMARCA2P51531 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SMARCA2P51531 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
SMARCA2P51531 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
SMARCA2P51531 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
SMARCA2P51531 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SMARCA2P51531 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SMARCA2P51531 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SMARCA2P51531 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
SMARCA2P51531 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SMARCA2P51531 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SMARCA2P51531 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
SMARCA2P51531 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SMARCA2P51531 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
SMARCA2P51531 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SMARCA2P51531 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SMARCA2P51531 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SMARCA2P51531 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
SMARCA2P51531 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SMARCA2P51531 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SMARCA2P51531 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SMARCA2P51531 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SMARCA2P51531 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.8 ms