Protein–RNA interactions for Protein: P50990

CCT8, T-complex protein 1 subunit theta, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT8P50990 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCT8P50990 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCT8P50990 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCT8P50990 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CCT8P50990 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCT8P50990 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCT8P50990 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CCT8P50990 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCT8P50990 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCT8P50990 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCT8P50990 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCT8P50990 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCT8P50990 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCT8P50990 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCT8P50990 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCT8P50990 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCT8P50990 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCT8P50990 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCT8P50990 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCT8P50990 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCT8P50990 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCT8P50990 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCT8P50990 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCT8P50990 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCT8P50990 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCT8P50990 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCT8P50990 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCT8P50990 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
CCT8P50990 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCT8P50990 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCT8P50990 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCT8P50990 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCT8P50990 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCT8P50990 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CCT8P50990 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCT8P50990 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCT8P50990 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCT8P50990 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCT8P50990 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCT8P50990 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCT8P50990 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCT8P50990 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCT8P50990 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCT8P50990 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCT8P50990 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCT8P50990 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCT8P50990 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCT8P50990 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCT8P50990 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCT8P50990 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCT8P50990 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCT8P50990 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCT8P50990 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCT8P50990 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCT8P50990 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCT8P50990 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCT8P50990 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCT8P50990 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCT8P50990 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCT8P50990 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCT8P50990 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCT8P50990 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCT8P50990 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCT8P50990 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCT8P50990 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCT8P50990 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCT8P50990 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCT8P50990 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCT8P50990 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCT8P50990 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCT8P50990 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCT8P50990 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCT8P50990 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCT8P50990 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CCT8P50990 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CCT8P50990 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CCT8P50990 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCT8P50990 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCT8P50990 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCT8P50990 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCT8P50990 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCT8P50990 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCT8P50990 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCT8P50990 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCT8P50990 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCT8P50990 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCT8P50990 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCT8P50990 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCT8P50990 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCT8P50990 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCT8P50990 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCT8P50990 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCT8P50990 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCT8P50990 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCT8P50990 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCT8P50990 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCT8P50990 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCT8P50990 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCT8P50990 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCT8P50990 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms