Protein–RNA interactions for Protein: P49848

TAF6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF6P49848 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TAF6P49848 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TAF6P49848 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TAF6P49848 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TAF6P49848 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TAF6P49848 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TAF6P49848 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TAF6P49848 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TAF6P49848 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TAF6P49848 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
TAF6P49848 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TAF6P49848 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
TAF6P49848 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TAF6P49848 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
TAF6P49848 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TAF6P49848 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TAF6P49848 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TAF6P49848 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TAF6P49848 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TAF6P49848 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TAF6P49848 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TAF6P49848 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TAF6P49848 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TAF6P49848 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TAF6P49848 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TAF6P49848 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TAF6P49848 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TAF6P49848 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TAF6P49848 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TAF6P49848 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TAF6P49848 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TAF6P49848 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TAF6P49848 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TAF6P49848 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TAF6P49848 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TAF6P49848 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TAF6P49848 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TAF6P49848 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TAF6P49848 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TAF6P49848 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TAF6P49848 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TAF6P49848 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TAF6P49848 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TAF6P49848 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TAF6P49848 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TAF6P49848 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TAF6P49848 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TAF6P49848 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TAF6P49848 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TAF6P49848 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TAF6P49848 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TAF6P49848 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TAF6P49848 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TAF6P49848 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TAF6P49848 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TAF6P49848 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TAF6P49848 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TAF6P49848 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TAF6P49848 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TAF6P49848 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TAF6P49848 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TAF6P49848 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TAF6P49848 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TAF6P49848 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TAF6P49848 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TAF6P49848 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TAF6P49848 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TAF6P49848 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TAF6P49848 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TAF6P49848 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TAF6P49848 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TAF6P49848 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TAF6P49848 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TAF6P49848 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TAF6P49848 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TAF6P49848 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TAF6P49848 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TAF6P49848 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TAF6P49848 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TAF6P49848 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TAF6P49848 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TAF6P49848 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TAF6P49848 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TAF6P49848 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TAF6P49848 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TAF6P49848 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TAF6P49848 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TAF6P49848 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TAF6P49848 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TAF6P49848 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TAF6P49848 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TAF6P49848 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TAF6P49848 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TAF6P49848 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TAF6P49848 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TAF6P49848 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TAF6P49848 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TAF6P49848 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TAF6P49848 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TAF6P49848 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms