Protein–RNA interactions for Protein: P48729

CSNK1A1, Casein kinase I isoform alpha, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1A1P48729 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CSNK1A1P48729 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CSNK1A1P48729 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CSNK1A1P48729 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CSNK1A1P48729 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CSNK1A1P48729 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CSNK1A1P48729 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CSNK1A1P48729 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CSNK1A1P48729 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CSNK1A1P48729 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CSNK1A1P48729 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CSNK1A1P48729 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CSNK1A1P48729 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CSNK1A1P48729 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CSNK1A1P48729 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CSNK1A1P48729 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CSNK1A1P48729 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CSNK1A1P48729 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CSNK1A1P48729 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CSNK1A1P48729 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CSNK1A1P48729 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CSNK1A1P48729 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
CSNK1A1P48729 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CSNK1A1P48729 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CSNK1A1P48729 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CSNK1A1P48729 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CSNK1A1P48729 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CSNK1A1P48729 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CSNK1A1P48729 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CSNK1A1P48729 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CSNK1A1P48729 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
CSNK1A1P48729 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CSNK1A1P48729 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CSNK1A1P48729 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CSNK1A1P48729 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CSNK1A1P48729 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CSNK1A1P48729 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CSNK1A1P48729 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CSNK1A1P48729 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CSNK1A1P48729 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CSNK1A1P48729 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CSNK1A1P48729 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CSNK1A1P48729 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
CSNK1A1P48729 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CSNK1A1P48729 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CSNK1A1P48729 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CSNK1A1P48729 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CSNK1A1P48729 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CSNK1A1P48729 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CSNK1A1P48729 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CSNK1A1P48729 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CSNK1A1P48729 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CSNK1A1P48729 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CSNK1A1P48729 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CSNK1A1P48729 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CSNK1A1P48729 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSNK1A1P48729 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSNK1A1P48729 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSNK1A1P48729 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSNK1A1P48729 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSNK1A1P48729 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CSNK1A1P48729 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSNK1A1P48729 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSNK1A1P48729 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CSNK1A1P48729 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSNK1A1P48729 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSNK1A1P48729 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CSNK1A1P48729 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSNK1A1P48729 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSNK1A1P48729 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSNK1A1P48729 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CSNK1A1P48729 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CSNK1A1P48729 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CSNK1A1P48729 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CSNK1A1P48729 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CSNK1A1P48729 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CSNK1A1P48729 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
CSNK1A1P48729 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CSNK1A1P48729 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CSNK1A1P48729 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CSNK1A1P48729 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CSNK1A1P48729 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSNK1A1P48729 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSNK1A1P48729 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSNK1A1P48729 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CSNK1A1P48729 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSNK1A1P48729 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CSNK1A1P48729 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSNK1A1P48729 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CSNK1A1P48729 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSNK1A1P48729 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CSNK1A1P48729 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSNK1A1P48729 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSNK1A1P48729 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CSNK1A1P48729 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSNK1A1P48729 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSNK1A1P48729 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSNK1A1P48729 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CSNK1A1P48729 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CSNK1A1P48729 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms