Protein–RNA interactions for Protein: P31327

CPS1, Carbamoyl-phosphate synthase [ammonia], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPS1P31327 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CPS1P31327 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CPS1P31327 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CPS1P31327 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CPS1P31327 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CPS1P31327 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CPS1P31327 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CPS1P31327 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CPS1P31327 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CPS1P31327 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CPS1P31327 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CPS1P31327 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CPS1P31327 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CPS1P31327 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CPS1P31327 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CPS1P31327 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CPS1P31327 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CPS1P31327 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CPS1P31327 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CPS1P31327 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CPS1P31327 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CPS1P31327 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CPS1P31327 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CPS1P31327 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CPS1P31327 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CPS1P31327 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CPS1P31327 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CPS1P31327 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CPS1P31327 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CPS1P31327 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CPS1P31327 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CPS1P31327 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CPS1P31327 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CPS1P31327 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CPS1P31327 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CPS1P31327 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CPS1P31327 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CPS1P31327 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CPS1P31327 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CPS1P31327 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CPS1P31327 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CPS1P31327 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CPS1P31327 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CPS1P31327 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CPS1P31327 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CPS1P31327 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CPS1P31327 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CPS1P31327 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CPS1P31327 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CPS1P31327 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CPS1P31327 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CPS1P31327 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CPS1P31327 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CPS1P31327 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CPS1P31327 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CPS1P31327 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CPS1P31327 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CPS1P31327 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CPS1P31327 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CPS1P31327 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CPS1P31327 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CPS1P31327 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CPS1P31327 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CPS1P31327 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CPS1P31327 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CPS1P31327 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CPS1P31327 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CPS1P31327 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CPS1P31327 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CPS1P31327 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CPS1P31327 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CPS1P31327 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CPS1P31327 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CPS1P31327 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CPS1P31327 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CPS1P31327 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CPS1P31327 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CPS1P31327 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CPS1P31327 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CPS1P31327 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CPS1P31327 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CPS1P31327 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CPS1P31327 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CPS1P31327 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CPS1P31327 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CPS1P31327 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CPS1P31327 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CPS1P31327 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CPS1P31327 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CPS1P31327 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CPS1P31327 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CPS1P31327 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CPS1P31327 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CPS1P31327 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CPS1P31327 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CPS1P31327 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CPS1P31327 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CPS1P31327 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CPS1P31327 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CPS1P31327 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms