Protein–RNA interactions for Protein: P31268

HOXA7, Homeobox protein Hox-A7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA7P31268 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXA7P31268 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXA7P31268 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXA7P31268 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXA7P31268 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXA7P31268 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXA7P31268 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXA7P31268 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXA7P31268 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXA7P31268 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXA7P31268 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXA7P31268 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXA7P31268 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXA7P31268 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXA7P31268 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXA7P31268 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXA7P31268 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXA7P31268 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXA7P31268 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXA7P31268 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXA7P31268 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXA7P31268 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXA7P31268 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXA7P31268 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXA7P31268 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXA7P31268 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXA7P31268 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXA7P31268 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXA7P31268 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXA7P31268 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXA7P31268 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXA7P31268 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXA7P31268 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXA7P31268 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXA7P31268 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXA7P31268 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXA7P31268 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXA7P31268 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXA7P31268 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXA7P31268 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXA7P31268 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXA7P31268 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXA7P31268 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXA7P31268 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXA7P31268 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXA7P31268 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXA7P31268 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXA7P31268 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXA7P31268 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXA7P31268 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXA7P31268 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXA7P31268 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXA7P31268 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXA7P31268 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXA7P31268 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXA7P31268 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXA7P31268 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXA7P31268 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXA7P31268 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXA7P31268 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXA7P31268 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXA7P31268 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXA7P31268 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXA7P31268 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXA7P31268 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXA7P31268 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXA7P31268 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXA7P31268 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXA7P31268 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXA7P31268 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXA7P31268 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXA7P31268 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXA7P31268 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXA7P31268 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXA7P31268 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXA7P31268 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXA7P31268 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXA7P31268 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXA7P31268 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXA7P31268 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXA7P31268 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXA7P31268 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXA7P31268 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXA7P31268 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXA7P31268 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXA7P31268 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXA7P31268 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXA7P31268 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXA7P31268 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXA7P31268 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXA7P31268 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXA7P31268 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXA7P31268 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXA7P31268 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXA7P31268 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXA7P31268 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXA7P31268 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXA7P31268 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXA7P31268 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXA7P31268 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms