Protein–RNA interactions for Protein: P31249

HOXD3, Homeobox protein Hox-D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD3P31249 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HOXD3P31249 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HOXD3P31249 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HOXD3P31249 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HOXD3P31249 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HOXD3P31249 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HOXD3P31249 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HOXD3P31249 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HOXD3P31249 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HOXD3P31249 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HOXD3P31249 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HOXD3P31249 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HOXD3P31249 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HOXD3P31249 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HOXD3P31249 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HOXD3P31249 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HOXD3P31249 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HOXD3P31249 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HOXD3P31249 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HOXD3P31249 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HOXD3P31249 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HOXD3P31249 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HOXD3P31249 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HOXD3P31249 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
HOXD3P31249 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HOXD3P31249 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
HOXD3P31249 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HOXD3P31249 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HOXD3P31249 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HOXD3P31249 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HOXD3P31249 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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HOXD3P31249 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
HOXD3P31249 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
HOXD3P31249 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HOXD3P31249 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HOXD3P31249 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HOXD3P31249 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HOXD3P31249 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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HOXD3P31249 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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HOXD3P31249 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HOXD3P31249 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HOXD3P31249 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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HOXD3P31249 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HOXD3P31249 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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HOXD3P31249 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
HOXD3P31249 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
HOXD3P31249 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
HOXD3P31249 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
HOXD3P31249 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
HOXD3P31249 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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HOXD3P31249 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
HOXD3P31249 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
HOXD3P31249 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
HOXD3P31249 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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HOXD3P31249 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
HOXD3P31249 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
HOXD3P31249 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
HOXD3P31249 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
HOXD3P31249 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
HOXD3P31249 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
HOXD3P31249 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
HOXD3P31249 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
HOXD3P31249 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
HOXD3P31249 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
HOXD3P31249 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC13.08□□□□□ -0.32
HOXD3P31249 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
HOXD3P31249 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
HOXD3P31249 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
HOXD3P31249 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
HOXD3P31249 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
HOXD3P31249 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
HOXD3P31249 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
HOXD3P31249 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
HOXD3P31249 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
HOXD3P31249 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
HOXD3P31249 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
HOXD3P31249 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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