Protein–RNA interactions for Protein: P26640

VARS, Valine--tRNA ligase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VARSP26640 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VARSP26640 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
VARSP26640 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VARSP26640 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VARSP26640 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VARSP26640 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VARSP26640 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VARSP26640 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VARSP26640 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VARSP26640 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VARSP26640 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VARSP26640 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VARSP26640 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
VARSP26640 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VARSP26640 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VARSP26640 IFNA4-201ENST00000421715 978 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VARSP26640 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VARSP26640 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VARSP26640 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VARSP26640 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VARSP26640 LINC02536-201ENST00000625799 625 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VARSP26640 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
VARSP26640 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VARSP26640 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VARSP26640 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VARSP26640 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VARSP26640 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VARSP26640 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VARSP26640 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VARSP26640 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VARSP26640 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VARSP26640 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
VARSP26640 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
VARSP26640 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
VARSP26640 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
VARSP26640 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
VARSP26640 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VARSP26640 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VARSP26640 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VARSP26640 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VARSP26640 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VARSP26640 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VARSP26640 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VARSP26640 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
VARSP26640 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VARSP26640 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VARSP26640 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VARSP26640 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VARSP26640 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VARSP26640 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VARSP26640 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VARSP26640 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VARSP26640 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VARSP26640 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VARSP26640 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VARSP26640 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VARSP26640 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VARSP26640 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VARSP26640 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VARSP26640 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VARSP26640 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VARSP26640 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
VARSP26640 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VARSP26640 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VARSP26640 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
VARSP26640 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VARSP26640 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VARSP26640 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VARSP26640 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VARSP26640 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VARSP26640 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
VARSP26640 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
VARSP26640 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VARSP26640 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VARSP26640 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VARSP26640 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VARSP26640 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VARSP26640 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VARSP26640 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VARSP26640 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VARSP26640 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VARSP26640 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VARSP26640 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
VARSP26640 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VARSP26640 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VARSP26640 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VARSP26640 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VARSP26640 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VARSP26640 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VARSP26640 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VARSP26640 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VARSP26640 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VARSP26640 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VARSP26640 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VARSP26640 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VARSP26640 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VARSP26640 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VARSP26640 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VARSP26640 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VARSP26640 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.7 ms