Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRBP23467 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRBP23467 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRBP23467 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRBP23467 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRBP23467 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRBP23467 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRBP23467 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRBP23467 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRBP23467 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRBP23467 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRBP23467 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRBP23467 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRBP23467 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRBP23467 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRBP23467 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRBP23467 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRBP23467 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRBP23467 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRBP23467 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRBP23467 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRBP23467 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRBP23467 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRBP23467 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRBP23467 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRBP23467 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRBP23467 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRBP23467 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRBP23467 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRBP23467 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRBP23467 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRBP23467 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRBP23467 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRBP23467 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRBP23467 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRBP23467 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRBP23467 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRBP23467 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRBP23467 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRBP23467 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRBP23467 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRBP23467 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRBP23467 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRBP23467 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRBP23467 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRBP23467 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRBP23467 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRBP23467 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRBP23467 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRBP23467 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRBP23467 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRBP23467 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRBP23467 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRBP23467 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRBP23467 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRBP23467 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRBP23467 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRBP23467 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRBP23467 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRBP23467 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRBP23467 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRBP23467 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRBP23467 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRBP23467 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRBP23467 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRBP23467 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRBP23467 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRBP23467 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRBP23467 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRBP23467 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRBP23467 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRBP23467 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRBP23467 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRBP23467 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRBP23467 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRBP23467 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRBP23467 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRBP23467 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRBP23467 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRBP23467 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRBP23467 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRBP23467 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRBP23467 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRBP23467 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRBP23467 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRBP23467 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRBP23467 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRBP23467 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRBP23467 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRBP23467 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRBP23467 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRBP23467 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRBP23467 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRBP23467 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRBP23467 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRBP23467 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRBP23467 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRBP23467 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPRBP23467 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPRBP23467 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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