Protein–RNA interactions for Protein: P20248

CCNA2, Cyclin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA2P20248 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms