Protein–RNA interactions for Protein: P13688

CEACAM1, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 1, humanhuman

Predictions only

Length 526 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEACAM1P13688 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CEACAM1P13688 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CEACAM1P13688 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CEACAM1P13688 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CEACAM1P13688 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CEACAM1P13688 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CEACAM1P13688 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CEACAM1P13688 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CEACAM1P13688 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CEACAM1P13688 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CEACAM1P13688 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CEACAM1P13688 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CEACAM1P13688 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CEACAM1P13688 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CEACAM1P13688 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CEACAM1P13688 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CEACAM1P13688 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CEACAM1P13688 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CEACAM1P13688 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CEACAM1P13688 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CEACAM1P13688 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CEACAM1P13688 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CEACAM1P13688 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CEACAM1P13688 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CEACAM1P13688 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CEACAM1P13688 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CEACAM1P13688 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CEACAM1P13688 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CEACAM1P13688 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CEACAM1P13688 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CEACAM1P13688 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CEACAM1P13688 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CEACAM1P13688 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CEACAM1P13688 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CEACAM1P13688 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CEACAM1P13688 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CEACAM1P13688 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CEACAM1P13688 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CEACAM1P13688 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CEACAM1P13688 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CEACAM1P13688 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CEACAM1P13688 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CEACAM1P13688 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CEACAM1P13688 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CEACAM1P13688 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CEACAM1P13688 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CEACAM1P13688 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CEACAM1P13688 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CEACAM1P13688 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CEACAM1P13688 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CEACAM1P13688 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CEACAM1P13688 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CEACAM1P13688 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CEACAM1P13688 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CEACAM1P13688 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CEACAM1P13688 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CEACAM1P13688 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CEACAM1P13688 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CEACAM1P13688 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CEACAM1P13688 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CEACAM1P13688 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CEACAM1P13688 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CEACAM1P13688 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CEACAM1P13688 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CEACAM1P13688 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CEACAM1P13688 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CEACAM1P13688 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CEACAM1P13688 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CEACAM1P13688 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CEACAM1P13688 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CEACAM1P13688 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CEACAM1P13688 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CEACAM1P13688 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CEACAM1P13688 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CEACAM1P13688 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CEACAM1P13688 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CEACAM1P13688 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CEACAM1P13688 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CEACAM1P13688 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CEACAM1P13688 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CEACAM1P13688 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CEACAM1P13688 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CEACAM1P13688 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CEACAM1P13688 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CEACAM1P13688 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CEACAM1P13688 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CEACAM1P13688 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CEACAM1P13688 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CEACAM1P13688 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CEACAM1P13688 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CEACAM1P13688 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CEACAM1P13688 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CEACAM1P13688 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CEACAM1P13688 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CEACAM1P13688 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CEACAM1P13688 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CEACAM1P13688 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CEACAM1P13688 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CEACAM1P13688 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CEACAM1P13688 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms