Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ACTN1P12814 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ACTN1P12814 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ACTN1P12814 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ACTN1P12814 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ACTN1P12814 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
ACTN1P12814 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
ACTN1P12814 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ACTN1P12814 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ACTN1P12814 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ACTN1P12814 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ACTN1P12814 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ACTN1P12814 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ACTN1P12814 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ACTN1P12814 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ACTN1P12814 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ACTN1P12814 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ACTN1P12814 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
ACTN1P12814 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ACTN1P12814 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ACTN1P12814 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ACTN1P12814 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ACTN1P12814 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ACTN1P12814 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ACTN1P12814 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ACTN1P12814 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ACTN1P12814 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ACTN1P12814 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ACTN1P12814 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ACTN1P12814 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ACTN1P12814 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ACTN1P12814 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ACTN1P12814 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ACTN1P12814 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ACTN1P12814 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ACTN1P12814 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ACTN1P12814 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ACTN1P12814 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ACTN1P12814 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ACTN1P12814 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
ACTN1P12814 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ACTN1P12814 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ACTN1P12814 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ACTN1P12814 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
ACTN1P12814 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ACTN1P12814 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ACTN1P12814 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ACTN1P12814 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ACTN1P12814 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ACTN1P12814 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ACTN1P12814 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ACTN1P12814 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ACTN1P12814 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ACTN1P12814 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
ACTN1P12814 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ACTN1P12814 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ACTN1P12814 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ACTN1P12814 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ACTN1P12814 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ACTN1P12814 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ACTN1P12814 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ACTN1P12814 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ACTN1P12814 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
ACTN1P12814 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ACTN1P12814 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ACTN1P12814 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ACTN1P12814 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ACTN1P12814 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ACTN1P12814 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ACTN1P12814 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ACTN1P12814 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ACTN1P12814 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ACTN1P12814 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ACTN1P12814 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ACTN1P12814 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ACTN1P12814 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ACTN1P12814 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ACTN1P12814 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ACTN1P12814 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ACTN1P12814 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ACTN1P12814 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ACTN1P12814 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ACTN1P12814 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ACTN1P12814 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ACTN1P12814 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ACTN1P12814 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ACTN1P12814 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ACTN1P12814 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
ACTN1P12814 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ACTN1P12814 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
ACTN1P12814 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ACTN1P12814 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ACTN1P12814 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ACTN1P12814 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ACTN1P12814 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ACTN1P12814 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ACTN1P12814 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ACTN1P12814 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ACTN1P12814 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ACTN1P12814 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms