Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.92□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms