Protein–RNA interactions for Protein: P11532

DMD, Dystrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DMDP11532 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DMDP11532 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DMDP11532 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DMDP11532 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DMDP11532 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DMDP11532 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DMDP11532 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DMDP11532 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DMDP11532 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DMDP11532 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DMDP11532 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DMDP11532 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DMDP11532 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DMDP11532 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DMDP11532 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DMDP11532 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DMDP11532 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DMDP11532 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DMDP11532 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DMDP11532 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
DMDP11532 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DMDP11532 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DMDP11532 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DMDP11532 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
DMDP11532 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DMDP11532 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DMDP11532 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DMDP11532 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DMDP11532 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DMDP11532 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DMDP11532 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DMDP11532 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DMDP11532 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
DMDP11532 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DMDP11532 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DMDP11532 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DMDP11532 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DMDP11532 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DMDP11532 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DMDP11532 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DMDP11532 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
DMDP11532 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DMDP11532 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DMDP11532 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DMDP11532 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DMDP11532 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DMDP11532 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
DMDP11532 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
DMDP11532 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DMDP11532 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DMDP11532 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DMDP11532 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
DMDP11532 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DMDP11532 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DMDP11532 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DMDP11532 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DMDP11532 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DMDP11532 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DMDP11532 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DMDP11532 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DMDP11532 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DMDP11532 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DMDP11532 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DMDP11532 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DMDP11532 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DMDP11532 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DMDP11532 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DMDP11532 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DMDP11532 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DMDP11532 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DMDP11532 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DMDP11532 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DMDP11532 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DMDP11532 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
DMDP11532 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
DMDP11532 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DMDP11532 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
DMDP11532 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DMDP11532 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DMDP11532 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
DMDP11532 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
DMDP11532 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DMDP11532 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DMDP11532 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DMDP11532 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DMDP11532 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DMDP11532 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DMDP11532 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DMDP11532 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DMDP11532 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DMDP11532 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DMDP11532 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DMDP11532 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DMDP11532 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DMDP11532 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
DMDP11532 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DMDP11532 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
DMDP11532 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DMDP11532 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DMDP11532 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms