Protein–RNA interactions for Protein: P11215

ITGAM, Integrin alpha-M, humanhuman

Predictions only

Length 1,152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAMP11215 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.6 ms