Protein–RNA interactions for Protein: P10147

CCL3, C-C motif chemokine 3, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3P10147 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL3P10147 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL3P10147 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL3P10147 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL3P10147 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL3P10147 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL3P10147 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL3P10147 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL3P10147 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL3P10147 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL3P10147 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL3P10147 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL3P10147 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL3P10147 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL3P10147 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL3P10147 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL3P10147 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL3P10147 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL3P10147 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL3P10147 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL3P10147 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL3P10147 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL3P10147 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL3P10147 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL3P10147 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL3P10147 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL3P10147 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL3P10147 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL3P10147 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL3P10147 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL3P10147 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL3P10147 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL3P10147 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL3P10147 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL3P10147 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL3P10147 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL3P10147 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL3P10147 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL3P10147 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL3P10147 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL3P10147 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL3P10147 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL3P10147 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL3P10147 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL3P10147 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL3P10147 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL3P10147 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL3P10147 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL3P10147 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL3P10147 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL3P10147 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL3P10147 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL3P10147 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL3P10147 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL3P10147 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL3P10147 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL3P10147 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL3P10147 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL3P10147 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL3P10147 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL3P10147 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL3P10147 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL3P10147 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL3P10147 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL3P10147 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL3P10147 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL3P10147 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL3P10147 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL3P10147 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL3P10147 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL3P10147 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL3P10147 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL3P10147 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL3P10147 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL3P10147 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL3P10147 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL3P10147 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL3P10147 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL3P10147 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL3P10147 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL3P10147 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL3P10147 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL3P10147 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL3P10147 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL3P10147 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL3P10147 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL3P10147 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL3P10147 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL3P10147 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL3P10147 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL3P10147 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL3P10147 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL3P10147 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL3P10147 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL3P10147 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL3P10147 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL3P10147 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL3P10147 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL3P10147 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL3P10147 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms