Protein–RNA interactions for Protein: P0DO97

CCDC192, Coiled-coil domain-containing protein 192, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC192P0DO97 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC192P0DO97 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC192P0DO97 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CCDC192P0DO97 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
CCDC192P0DO97 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
CCDC192P0DO97 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CCDC192P0DO97 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CCDC192P0DO97 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CCDC192P0DO97 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CCDC192P0DO97 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CCDC192P0DO97 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
CCDC192P0DO97 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
CCDC192P0DO97 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
CCDC192P0DO97 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CCDC192P0DO97 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CCDC192P0DO97 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC192P0DO97 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC192P0DO97 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC192P0DO97 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC192P0DO97 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC192P0DO97 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC192P0DO97 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC192P0DO97 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC192P0DO97 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC192P0DO97 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC192P0DO97 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC192P0DO97 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC192P0DO97 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC192P0DO97 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC192P0DO97 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC192P0DO97 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC192P0DO97 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC192P0DO97 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC192P0DO97 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC192P0DO97 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC192P0DO97 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC192P0DO97 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC192P0DO97 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC192P0DO97 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC192P0DO97 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC192P0DO97 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC192P0DO97 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC192P0DO97 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC192P0DO97 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC192P0DO97 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC192P0DO97 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC192P0DO97 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC192P0DO97 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC192P0DO97 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC192P0DO97 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC192P0DO97 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC192P0DO97 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC192P0DO97 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC192P0DO97 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC192P0DO97 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC192P0DO97 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC192P0DO97 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC192P0DO97 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC192P0DO97 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC192P0DO97 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC192P0DO97 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC192P0DO97 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC192P0DO97 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC192P0DO97 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC192P0DO97 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC192P0DO97 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC192P0DO97 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC192P0DO97 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC192P0DO97 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC192P0DO97 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC192P0DO97 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC192P0DO97 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC192P0DO97 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC192P0DO97 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC192P0DO97 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC192P0DO97 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC192P0DO97 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC192P0DO97 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC192P0DO97 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC192P0DO97 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC192P0DO97 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC192P0DO97 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC192P0DO97 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC192P0DO97 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC192P0DO97 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC192P0DO97 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC192P0DO97 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC192P0DO97 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC192P0DO97 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC192P0DO97 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC192P0DO97 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC192P0DO97 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC192P0DO97 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC192P0DO97 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC192P0DO97 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC192P0DO97 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC192P0DO97 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC192P0DO97 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC192P0DO97 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC192P0DO97 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms