Protein–RNA interactions for Protein: P0DI82

TRAPPC2B, Trafficking protein particle complex subunit 2B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2BP0DI82 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC2BP0DI82 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC2BP0DI82 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC2BP0DI82 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC2BP0DI82 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC2BP0DI82 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC2BP0DI82 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC2BP0DI82 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC2BP0DI82 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC2BP0DI82 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC2BP0DI82 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC2BP0DI82 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC2BP0DI82 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC2BP0DI82 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC2BP0DI82 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC2BP0DI82 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC2BP0DI82 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC2BP0DI82 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC2BP0DI82 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC2BP0DI82 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC2BP0DI82 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC2BP0DI82 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC2BP0DI82 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC2BP0DI82 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC2BP0DI82 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC2BP0DI82 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC2BP0DI82 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC2BP0DI82 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC2BP0DI82 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC2BP0DI82 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC2BP0DI82 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC2BP0DI82 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC2BP0DI82 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC2BP0DI82 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC2BP0DI82 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC2BP0DI82 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC2BP0DI82 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC2BP0DI82 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC2BP0DI82 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC2BP0DI82 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC2BP0DI82 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC2BP0DI82 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC2BP0DI82 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC2BP0DI82 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC2BP0DI82 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC2BP0DI82 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC2BP0DI82 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC2BP0DI82 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC2BP0DI82 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC2BP0DI82 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC2BP0DI82 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC2BP0DI82 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC2BP0DI82 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC2BP0DI82 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC2BP0DI82 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC2BP0DI82 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC2BP0DI82 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC2BP0DI82 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC2BP0DI82 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC2BP0DI82 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC2BP0DI82 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC2BP0DI82 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC2BP0DI82 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC2BP0DI82 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC2BP0DI82 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC2BP0DI82 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC2BP0DI82 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC2BP0DI82 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC2BP0DI82 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC2BP0DI82 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC2BP0DI82 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC2BP0DI82 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC2BP0DI82 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC2BP0DI82 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC2BP0DI82 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC2BP0DI82 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC2BP0DI82 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC2BP0DI82 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC2BP0DI82 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC2BP0DI82 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC2BP0DI82 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC2BP0DI82 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC2BP0DI82 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC2BP0DI82 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC2BP0DI82 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC2BP0DI82 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC2BP0DI82 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC2BP0DI82 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC2BP0DI82 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC2BP0DI82 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC2BP0DI82 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC2BP0DI82 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC2BP0DI82 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC2BP0DI82 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC2BP0DI82 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC2BP0DI82 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC2BP0DI82 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC2BP0DI82 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC2BP0DI82 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC2BP0DI82 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
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