Protein–RNA interactions for Protein: P0DI81

TRAPPC2, Trafficking protein particle complex subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2P0DI81 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC2P0DI81 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC2P0DI81 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC2P0DI81 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC2P0DI81 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC2P0DI81 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC2P0DI81 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC2P0DI81 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC2P0DI81 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC2P0DI81 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC2P0DI81 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC2P0DI81 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC2P0DI81 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC2P0DI81 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC2P0DI81 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC2P0DI81 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC2P0DI81 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC2P0DI81 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC2P0DI81 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC2P0DI81 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC2P0DI81 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC2P0DI81 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC2P0DI81 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC2P0DI81 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC2P0DI81 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC2P0DI81 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC2P0DI81 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC2P0DI81 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC2P0DI81 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC2P0DI81 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC2P0DI81 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC2P0DI81 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC2P0DI81 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC2P0DI81 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC2P0DI81 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC2P0DI81 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC2P0DI81 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC2P0DI81 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC2P0DI81 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC2P0DI81 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC2P0DI81 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC2P0DI81 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC2P0DI81 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC2P0DI81 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC2P0DI81 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC2P0DI81 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC2P0DI81 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC2P0DI81 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC2P0DI81 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC2P0DI81 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC2P0DI81 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC2P0DI81 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC2P0DI81 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC2P0DI81 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC2P0DI81 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC2P0DI81 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC2P0DI81 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC2P0DI81 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC2P0DI81 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC2P0DI81 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC2P0DI81 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC2P0DI81 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC2P0DI81 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC2P0DI81 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC2P0DI81 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC2P0DI81 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC2P0DI81 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC2P0DI81 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC2P0DI81 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC2P0DI81 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC2P0DI81 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC2P0DI81 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC2P0DI81 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC2P0DI81 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC2P0DI81 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC2P0DI81 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC2P0DI81 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC2P0DI81 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC2P0DI81 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC2P0DI81 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC2P0DI81 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC2P0DI81 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC2P0DI81 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC2P0DI81 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC2P0DI81 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC2P0DI81 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC2P0DI81 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC2P0DI81 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC2P0DI81 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC2P0DI81 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC2P0DI81 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC2P0DI81 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC2P0DI81 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC2P0DI81 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC2P0DI81 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC2P0DI81 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC2P0DI81 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC2P0DI81 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC2P0DI81 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC2P0DI81 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms