Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

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Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRCP08575 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRCP08575 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRCP08575 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRCP08575 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRCP08575 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRCP08575 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRCP08575 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRCP08575 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRCP08575 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRCP08575 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRCP08575 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRCP08575 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRCP08575 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRCP08575 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRCP08575 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRCP08575 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRCP08575 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRCP08575 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRCP08575 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRCP08575 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRCP08575 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRCP08575 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRCP08575 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PTPRCP08575 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRCP08575 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRCP08575 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PTPRCP08575 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PTPRCP08575 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PTPRCP08575 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PTPRCP08575 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PTPRCP08575 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PTPRCP08575 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PTPRCP08575 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PTPRCP08575 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PTPRCP08575 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PTPRCP08575 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PTPRCP08575 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PTPRCP08575 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PTPRCP08575 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PTPRCP08575 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PTPRCP08575 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PTPRCP08575 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
PTPRCP08575 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PTPRCP08575 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PTPRCP08575 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PTPRCP08575 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PTPRCP08575 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PTPRCP08575 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PTPRCP08575 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PTPRCP08575 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PTPRCP08575 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PTPRCP08575 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PTPRCP08575 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PTPRCP08575 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRCP08575 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRCP08575 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRCP08575 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRCP08575 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRCP08575 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRCP08575 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRCP08575 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRCP08575 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRCP08575 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRCP08575 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRCP08575 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRCP08575 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
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PTPRCP08575 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRCP08575 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
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PTPRCP08575 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
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PTPRCP08575 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRCP08575 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRCP08575 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
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PTPRCP08575 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRCP08575 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRCP08575 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRCP08575 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
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PTPRCP08575 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
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PTPRCP08575 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRCP08575 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRCP08575 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRCP08575 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRCP08575 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRCP08575 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRCP08575 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRCP08575 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRCP08575 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRCP08575 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRCP08575 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
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