Protein–RNA interactions for Protein: P01857

IGHG1, Immunoglobulin heavy constant gamma 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHG1P01857 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IGHG1P01857 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IGHG1P01857 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IGHG1P01857 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IGHG1P01857 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IGHG1P01857 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IGHG1P01857 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IGHG1P01857 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IGHG1P01857 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IGHG1P01857 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
IGHG1P01857 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
IGHG1P01857 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
IGHG1P01857 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
IGHG1P01857 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
IGHG1P01857 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
IGHG1P01857 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
IGHG1P01857 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
IGHG1P01857 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
IGHG1P01857 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IGHG1P01857 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
IGHG1P01857 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IGHG1P01857 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
IGHG1P01857 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IGHG1P01857 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
IGHG1P01857 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
IGHG1P01857 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IGHG1P01857 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IGHG1P01857 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IGHG1P01857 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC15.08■□□□□ 0
IGHG1P01857 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IGHG1P01857 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC15.08■□□□□ 0
IGHG1P01857 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
IGHG1P01857 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
IGHG1P01857 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
IGHG1P01857 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
IGHG1P01857 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC15.08■□□□□ 0
IGHG1P01857 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
IGHG1P01857 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
IGHG1P01857 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
IGHG1P01857 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
IGHG1P01857 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
IGHG1P01857 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC15.08■□□□□ 0
IGHG1P01857 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IGHG1P01857 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.08■□□□□ 0
IGHG1P01857 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
IGHG1P01857 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IGHG1P01857 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
IGHG1P01857 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
IGHG1P01857 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IGHG1P01857 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
IGHG1P01857 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IGHG1P01857 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IGHG1P01857 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IGHG1P01857 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IGHG1P01857 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.08■□□□□ 0
IGHG1P01857 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
IGHG1P01857 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
IGHG1P01857 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IGHG1P01857 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IGHG1P01857 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IGHG1P01857 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IGHG1P01857 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
IGHG1P01857 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
IGHG1P01857 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IGHG1P01857 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IGHG1P01857 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IGHG1P01857 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IGHG1P01857 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IGHG1P01857 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.07■□□□□ 0
IGHG1P01857 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
IGHG1P01857 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IGHG1P01857 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
IGHG1P01857 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IGHG1P01857 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
IGHG1P01857 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IGHG1P01857 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IGHG1P01857 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
IGHG1P01857 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
IGHG1P01857 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
IGHG1P01857 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
IGHG1P01857 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
IGHG1P01857 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
IGHG1P01857 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
IGHG1P01857 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC15.07■□□□□ 0
IGHG1P01857 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
IGHG1P01857 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC15.07■□□□□ 0
IGHG1P01857 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
IGHG1P01857 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
IGHG1P01857 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
IGHG1P01857 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
IGHG1P01857 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
IGHG1P01857 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC15.07■□□□□ 0
IGHG1P01857 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC15.07■□□□□ 0
IGHG1P01857 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
IGHG1P01857 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IGHG1P01857 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IGHG1P01857 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
IGHG1P01857 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
IGHG1P01857 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
IGHG1P01857 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms