Protein–RNA interactions for Protein: O75145

PPFIA3, Liprin-alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA3O75145 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PPFIA3O75145 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PPFIA3O75145 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PPFIA3O75145 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PPFIA3O75145 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PPFIA3O75145 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PPFIA3O75145 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PPFIA3O75145 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PPFIA3O75145 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PPFIA3O75145 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PPFIA3O75145 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PPFIA3O75145 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PPFIA3O75145 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PPFIA3O75145 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PPFIA3O75145 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PPFIA3O75145 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
PPFIA3O75145 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PPFIA3O75145 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
PPFIA3O75145 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
PPFIA3O75145 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PPFIA3O75145 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PPFIA3O75145 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PPFIA3O75145 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PPFIA3O75145 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PPFIA3O75145 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
PPFIA3O75145 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PPFIA3O75145 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PPFIA3O75145 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PPFIA3O75145 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PPFIA3O75145 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
PPFIA3O75145 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PPFIA3O75145 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PPFIA3O75145 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PPFIA3O75145 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PPFIA3O75145 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
PPFIA3O75145 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PPFIA3O75145 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PPFIA3O75145 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PPFIA3O75145 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PPFIA3O75145 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PPFIA3O75145 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PPFIA3O75145 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PPFIA3O75145 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PPFIA3O75145 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PPFIA3O75145 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PPFIA3O75145 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PPFIA3O75145 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PPFIA3O75145 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PPFIA3O75145 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PPFIA3O75145 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
PPFIA3O75145 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PPFIA3O75145 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PPFIA3O75145 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PPFIA3O75145 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PPFIA3O75145 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PPFIA3O75145 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PPFIA3O75145 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
PPFIA3O75145 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PPFIA3O75145 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PPFIA3O75145 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PPFIA3O75145 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PPFIA3O75145 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PPFIA3O75145 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PPFIA3O75145 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PPFIA3O75145 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PPFIA3O75145 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PPFIA3O75145 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PPFIA3O75145 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PPFIA3O75145 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PPFIA3O75145 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PPFIA3O75145 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PPFIA3O75145 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PPFIA3O75145 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PPFIA3O75145 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PPFIA3O75145 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
PPFIA3O75145 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PPFIA3O75145 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PPFIA3O75145 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PPFIA3O75145 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PPFIA3O75145 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PPFIA3O75145 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PPFIA3O75145 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PPFIA3O75145 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PPFIA3O75145 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PPFIA3O75145 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PPFIA3O75145 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PPFIA3O75145 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PPFIA3O75145 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PPFIA3O75145 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PPFIA3O75145 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
PPFIA3O75145 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PPFIA3O75145 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PPFIA3O75145 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
PPFIA3O75145 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
PPFIA3O75145 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
PPFIA3O75145 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PPFIA3O75145 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PPFIA3O75145 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PPFIA3O75145 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PPFIA3O75145 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms