Protein–RNA interactions for Protein: O60911

CTSV, Cathepsin L2, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSVO60911 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTSVO60911 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTSVO60911 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTSVO60911 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTSVO60911 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTSVO60911 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTSVO60911 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTSVO60911 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTSVO60911 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTSVO60911 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTSVO60911 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTSVO60911 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTSVO60911 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTSVO60911 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTSVO60911 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTSVO60911 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTSVO60911 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTSVO60911 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTSVO60911 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTSVO60911 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTSVO60911 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTSVO60911 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTSVO60911 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTSVO60911 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTSVO60911 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CTSVO60911 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTSVO60911 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTSVO60911 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTSVO60911 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTSVO60911 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTSVO60911 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTSVO60911 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTSVO60911 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CTSVO60911 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTSVO60911 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTSVO60911 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTSVO60911 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTSVO60911 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTSVO60911 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTSVO60911 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CTSVO60911 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTSVO60911 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CTSVO60911 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTSVO60911 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CTSVO60911 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CTSVO60911 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTSVO60911 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTSVO60911 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTSVO60911 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTSVO60911 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTSVO60911 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTSVO60911 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTSVO60911 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTSVO60911 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTSVO60911 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTSVO60911 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTSVO60911 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTSVO60911 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTSVO60911 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTSVO60911 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTSVO60911 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTSVO60911 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTSVO60911 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTSVO60911 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTSVO60911 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTSVO60911 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTSVO60911 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTSVO60911 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTSVO60911 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTSVO60911 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTSVO60911 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTSVO60911 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTSVO60911 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTSVO60911 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTSVO60911 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTSVO60911 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTSVO60911 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTSVO60911 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTSVO60911 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTSVO60911 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTSVO60911 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTSVO60911 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTSVO60911 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTSVO60911 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTSVO60911 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTSVO60911 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTSVO60911 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CTSVO60911 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CTSVO60911 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTSVO60911 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTSVO60911 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTSVO60911 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTSVO60911 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTSVO60911 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTSVO60911 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CTSVO60911 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTSVO60911 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTSVO60911 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTSVO60911 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTSVO60911 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.7 ms