Protein–RNA interactions for Protein: O14727

APAF1, Apoptotic protease-activating factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APAF1O14727 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
APAF1O14727 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
APAF1O14727 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
APAF1O14727 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
APAF1O14727 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
APAF1O14727 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
APAF1O14727 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
APAF1O14727 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
APAF1O14727 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
APAF1O14727 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
APAF1O14727 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
APAF1O14727 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
APAF1O14727 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
APAF1O14727 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
APAF1O14727 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
APAF1O14727 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
APAF1O14727 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
APAF1O14727 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
APAF1O14727 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
APAF1O14727 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
APAF1O14727 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
APAF1O14727 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
APAF1O14727 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
APAF1O14727 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
APAF1O14727 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
APAF1O14727 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
APAF1O14727 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
APAF1O14727 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
APAF1O14727 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
APAF1O14727 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
APAF1O14727 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
APAF1O14727 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
APAF1O14727 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
APAF1O14727 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
APAF1O14727 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
APAF1O14727 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
APAF1O14727 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
APAF1O14727 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
APAF1O14727 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
APAF1O14727 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
APAF1O14727 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
APAF1O14727 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
APAF1O14727 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
APAF1O14727 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
APAF1O14727 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
APAF1O14727 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
APAF1O14727 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
APAF1O14727 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
APAF1O14727 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
APAF1O14727 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
APAF1O14727 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
APAF1O14727 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
APAF1O14727 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
APAF1O14727 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
APAF1O14727 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
APAF1O14727 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
APAF1O14727 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
APAF1O14727 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
APAF1O14727 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
APAF1O14727 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
APAF1O14727 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
APAF1O14727 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
APAF1O14727 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
APAF1O14727 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
APAF1O14727 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
APAF1O14727 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
APAF1O14727 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
APAF1O14727 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
APAF1O14727 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
APAF1O14727 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
APAF1O14727 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
APAF1O14727 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
APAF1O14727 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
APAF1O14727 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
APAF1O14727 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
APAF1O14727 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
APAF1O14727 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
APAF1O14727 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
APAF1O14727 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
APAF1O14727 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
APAF1O14727 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
APAF1O14727 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
APAF1O14727 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
APAF1O14727 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
APAF1O14727 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
APAF1O14727 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
APAF1O14727 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
APAF1O14727 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
APAF1O14727 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
APAF1O14727 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
APAF1O14727 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
APAF1O14727 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
APAF1O14727 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
APAF1O14727 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
APAF1O14727 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
APAF1O14727 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
APAF1O14727 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
APAF1O14727 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
APAF1O14727 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
APAF1O14727 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms