Protein–RNA interactions for Protein: H7C1D1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C1D1 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
H7C1D1 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
H7C1D1 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
H7C1D1 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
H7C1D1 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
H7C1D1 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
H7C1D1 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
H7C1D1 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
H7C1D1 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
H7C1D1 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
H7C1D1 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
H7C1D1 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
H7C1D1 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
H7C1D1 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
H7C1D1 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
H7C1D1 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
H7C1D1 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
H7C1D1 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
H7C1D1 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
H7C1D1 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
H7C1D1 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
H7C1D1 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
H7C1D1 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
H7C1D1 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
H7C1D1 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
H7C1D1 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
H7C1D1 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
H7C1D1 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
H7C1D1 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
H7C1D1 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
H7C1D1 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
H7C1D1 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
H7C1D1 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
H7C1D1 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
H7C1D1 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
H7C1D1 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
H7C1D1 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
H7C1D1 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
H7C1D1 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
H7C1D1 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
H7C1D1 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
H7C1D1 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
H7C1D1 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
H7C1D1 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
H7C1D1 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
H7C1D1 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
H7C1D1 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
H7C1D1 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
H7C1D1 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
H7C1D1 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
H7C1D1 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
H7C1D1 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
H7C1D1 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
H7C1D1 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
H7C1D1 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
H7C1D1 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
H7C1D1 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
H7C1D1 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
H7C1D1 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
H7C1D1 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
H7C1D1 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
H7C1D1 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
H7C1D1 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
H7C1D1 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
H7C1D1 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
H7C1D1 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
H7C1D1 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
H7C1D1 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
H7C1D1 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
H7C1D1 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
H7C1D1 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
H7C1D1 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
H7C1D1 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
H7C1D1 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
H7C1D1 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
H7C1D1 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
H7C1D1 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
H7C1D1 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
H7C1D1 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
H7C1D1 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
H7C1D1 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
H7C1D1 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
H7C1D1 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
H7C1D1 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
H7C1D1 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
H7C1D1 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
H7C1D1 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
H7C1D1 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
H7C1D1 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
H7C1D1 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
H7C1D1 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
H7C1D1 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
H7C1D1 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
H7C1D1 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
H7C1D1 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
H7C1D1 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
H7C1D1 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
H7C1D1 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
H7C1D1 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
H7C1D1 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms