Protein–RNA interactions for Protein: F8W1W9

NPIPB9, Nuclear pore complex-interacting protein family member B9, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB9F8W1W9 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPIPB9F8W1W9 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPIPB9F8W1W9 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPIPB9F8W1W9 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NPIPB9F8W1W9 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPIPB9F8W1W9 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPIPB9F8W1W9 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPIPB9F8W1W9 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPIPB9F8W1W9 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPIPB9F8W1W9 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPIPB9F8W1W9 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPIPB9F8W1W9 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPIPB9F8W1W9 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPIPB9F8W1W9 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPIPB9F8W1W9 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPIPB9F8W1W9 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPIPB9F8W1W9 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPIPB9F8W1W9 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPIPB9F8W1W9 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPIPB9F8W1W9 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPIPB9F8W1W9 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NPIPB9F8W1W9 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPIPB9F8W1W9 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPIPB9F8W1W9 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPIPB9F8W1W9 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPIPB9F8W1W9 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPIPB9F8W1W9 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPIPB9F8W1W9 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NPIPB9F8W1W9 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPIPB9F8W1W9 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPIPB9F8W1W9 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPIPB9F8W1W9 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPIPB9F8W1W9 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPIPB9F8W1W9 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPIPB9F8W1W9 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPIPB9F8W1W9 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NPIPB9F8W1W9 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPIPB9F8W1W9 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPIPB9F8W1W9 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPIPB9F8W1W9 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPIPB9F8W1W9 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPIPB9F8W1W9 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPIPB9F8W1W9 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPIPB9F8W1W9 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPIPB9F8W1W9 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPIPB9F8W1W9 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPIPB9F8W1W9 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPIPB9F8W1W9 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPIPB9F8W1W9 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPIPB9F8W1W9 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPIPB9F8W1W9 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPIPB9F8W1W9 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPIPB9F8W1W9 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPIPB9F8W1W9 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPIPB9F8W1W9 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPIPB9F8W1W9 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPIPB9F8W1W9 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPIPB9F8W1W9 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPIPB9F8W1W9 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPIPB9F8W1W9 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NPIPB9F8W1W9 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPIPB9F8W1W9 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPIPB9F8W1W9 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPIPB9F8W1W9 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPIPB9F8W1W9 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPIPB9F8W1W9 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPIPB9F8W1W9 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPIPB9F8W1W9 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPB9F8W1W9 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPB9F8W1W9 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPB9F8W1W9 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPB9F8W1W9 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPB9F8W1W9 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPB9F8W1W9 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPB9F8W1W9 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPB9F8W1W9 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPB9F8W1W9 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPB9F8W1W9 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPB9F8W1W9 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPB9F8W1W9 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPB9F8W1W9 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPB9F8W1W9 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPB9F8W1W9 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPB9F8W1W9 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPB9F8W1W9 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPB9F8W1W9 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPB9F8W1W9 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPB9F8W1W9 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPB9F8W1W9 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPB9F8W1W9 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPB9F8W1W9 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPB9F8W1W9 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPB9F8W1W9 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPB9F8W1W9 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPB9F8W1W9 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPB9F8W1W9 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPB9F8W1W9 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPB9F8W1W9 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPB9F8W1W9 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPB9F8W1W9 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms