Protein–RNA interactions for Protein: F6WH68

RTEL1-TNFRSF6B, Regulator of telomere elongation helicase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms