Protein–RNA interactions for Protein: C9JE40

PATL2, Protein PAT1 homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATL2C9JE40 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PATL2C9JE40 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PATL2C9JE40 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PATL2C9JE40 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PATL2C9JE40 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PATL2C9JE40 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PATL2C9JE40 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PATL2C9JE40 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PATL2C9JE40 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PATL2C9JE40 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PATL2C9JE40 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PATL2C9JE40 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PATL2C9JE40 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PATL2C9JE40 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PATL2C9JE40 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PATL2C9JE40 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PATL2C9JE40 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PATL2C9JE40 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PATL2C9JE40 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PATL2C9JE40 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PATL2C9JE40 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PATL2C9JE40 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PATL2C9JE40 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PATL2C9JE40 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PATL2C9JE40 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PATL2C9JE40 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PATL2C9JE40 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PATL2C9JE40 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PATL2C9JE40 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PATL2C9JE40 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PATL2C9JE40 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PATL2C9JE40 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PATL2C9JE40 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PATL2C9JE40 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PATL2C9JE40 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PATL2C9JE40 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PATL2C9JE40 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PATL2C9JE40 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PATL2C9JE40 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PATL2C9JE40 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PATL2C9JE40 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PATL2C9JE40 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PATL2C9JE40 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PATL2C9JE40 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PATL2C9JE40 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PATL2C9JE40 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PATL2C9JE40 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PATL2C9JE40 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PATL2C9JE40 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PATL2C9JE40 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PATL2C9JE40 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PATL2C9JE40 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PATL2C9JE40 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PATL2C9JE40 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PATL2C9JE40 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PATL2C9JE40 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PATL2C9JE40 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PATL2C9JE40 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PATL2C9JE40 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PATL2C9JE40 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PATL2C9JE40 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PATL2C9JE40 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PATL2C9JE40 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PATL2C9JE40 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PATL2C9JE40 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PATL2C9JE40 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PATL2C9JE40 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PATL2C9JE40 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PATL2C9JE40 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PATL2C9JE40 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PATL2C9JE40 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PATL2C9JE40 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PATL2C9JE40 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PATL2C9JE40 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PATL2C9JE40 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PATL2C9JE40 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PATL2C9JE40 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PATL2C9JE40 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PATL2C9JE40 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PATL2C9JE40 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PATL2C9JE40 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PATL2C9JE40 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PATL2C9JE40 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PATL2C9JE40 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PATL2C9JE40 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PATL2C9JE40 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PATL2C9JE40 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PATL2C9JE40 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PATL2C9JE40 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PATL2C9JE40 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PATL2C9JE40 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PATL2C9JE40 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PATL2C9JE40 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PATL2C9JE40 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PATL2C9JE40 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PATL2C9JE40 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PATL2C9JE40 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PATL2C9JE40 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PATL2C9JE40 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PATL2C9JE40 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms