Protein–RNA interactions for Protein: B4DJY2

TMEM233, Transmembrane protein 233, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM233B4DJY2 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM233B4DJY2 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM233B4DJY2 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM233B4DJY2 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM233B4DJY2 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM233B4DJY2 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM233B4DJY2 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM233B4DJY2 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM233B4DJY2 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM233B4DJY2 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM233B4DJY2 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM233B4DJY2 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM233B4DJY2 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM233B4DJY2 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM233B4DJY2 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM233B4DJY2 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM233B4DJY2 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM233B4DJY2 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM233B4DJY2 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM233B4DJY2 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM233B4DJY2 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM233B4DJY2 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM233B4DJY2 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM233B4DJY2 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM233B4DJY2 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM233B4DJY2 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM233B4DJY2 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM233B4DJY2 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM233B4DJY2 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM233B4DJY2 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM233B4DJY2 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM233B4DJY2 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM233B4DJY2 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM233B4DJY2 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM233B4DJY2 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM233B4DJY2 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM233B4DJY2 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM233B4DJY2 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM233B4DJY2 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM233B4DJY2 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM233B4DJY2 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM233B4DJY2 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM233B4DJY2 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM233B4DJY2 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM233B4DJY2 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM233B4DJY2 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM233B4DJY2 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM233B4DJY2 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM233B4DJY2 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM233B4DJY2 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM233B4DJY2 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM233B4DJY2 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM233B4DJY2 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM233B4DJY2 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM233B4DJY2 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM233B4DJY2 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM233B4DJY2 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM233B4DJY2 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM233B4DJY2 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM233B4DJY2 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM233B4DJY2 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM233B4DJY2 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM233B4DJY2 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM233B4DJY2 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM233B4DJY2 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM233B4DJY2 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM233B4DJY2 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM233B4DJY2 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM233B4DJY2 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM233B4DJY2 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM233B4DJY2 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM233B4DJY2 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM233B4DJY2 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM233B4DJY2 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM233B4DJY2 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM233B4DJY2 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM233B4DJY2 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM233B4DJY2 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM233B4DJY2 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM233B4DJY2 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM233B4DJY2 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM233B4DJY2 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM233B4DJY2 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM233B4DJY2 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM233B4DJY2 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM233B4DJY2 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM233B4DJY2 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM233B4DJY2 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM233B4DJY2 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM233B4DJY2 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM233B4DJY2 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM233B4DJY2 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM233B4DJY2 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM233B4DJY2 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM233B4DJY2 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM233B4DJY2 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM233B4DJY2 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM233B4DJY2 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM233B4DJY2 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM233B4DJY2 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms