Protein–RNA interactions for Protein: A6NNM8

TTLL13P, Tubulin polyglutamylase TTLL13P, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL13PA6NNM8 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TTLL13PA6NNM8 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TTLL13PA6NNM8 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TTLL13PA6NNM8 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TTLL13PA6NNM8 SPATA4-201ENST00000280191 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TTLL13PA6NNM8 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TTLL13PA6NNM8 PMCHL1-203ENST00000423301 697 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TTLL13PA6NNM8 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TTLL13PA6NNM8 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TTLL13PA6NNM8 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TTLL13PA6NNM8 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TTLL13PA6NNM8 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TTLL13PA6NNM8 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TTLL13PA6NNM8 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TTLL13PA6NNM8 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TTLL13PA6NNM8 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TTLL13PA6NNM8 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TTLL13PA6NNM8 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TTLL13PA6NNM8 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TTLL13PA6NNM8 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TTLL13PA6NNM8 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TTLL13PA6NNM8 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TTLL13PA6NNM8 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
TTLL13PA6NNM8 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
TTLL13PA6NNM8 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
TTLL13PA6NNM8 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TTLL13PA6NNM8 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TTLL13PA6NNM8 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TTLL13PA6NNM8 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TTLL13PA6NNM8 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TTLL13PA6NNM8 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TTLL13PA6NNM8 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TTLL13PA6NNM8 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TTLL13PA6NNM8 RN7SKP199-201ENST00000410325 305 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TTLL13PA6NNM8 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TTLL13PA6NNM8 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TTLL13PA6NNM8 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TTLL13PA6NNM8 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TTLL13PA6NNM8 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TTLL13PA6NNM8 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TTLL13PA6NNM8 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TTLL13PA6NNM8 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TTLL13PA6NNM8 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TTLL13PA6NNM8 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TTLL13PA6NNM8 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TTLL13PA6NNM8 AL079304.1-201ENST00000554595 828 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TTLL13PA6NNM8 AC110921.1-201ENST00000577544 612 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TTLL13PA6NNM8 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TTLL13PA6NNM8 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TTLL13PA6NNM8 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TTLL13PA6NNM8 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TTLL13PA6NNM8 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TTLL13PA6NNM8 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TTLL13PA6NNM8 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TTLL13PA6NNM8 SMIM11B-202ENST00000619874 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TTLL13PA6NNM8 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TTLL13PA6NNM8 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TTLL13PA6NNM8 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TTLL13PA6NNM8 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TTLL13PA6NNM8 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TTLL13PA6NNM8 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TTLL13PA6NNM8 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TTLL13PA6NNM8 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TTLL13PA6NNM8 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TTLL13PA6NNM8 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TTLL13PA6NNM8 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TTLL13PA6NNM8 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TTLL13PA6NNM8 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TTLL13PA6NNM8 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TTLL13PA6NNM8 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TTLL13PA6NNM8 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TTLL13PA6NNM8 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TTLL13PA6NNM8 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TTLL13PA6NNM8 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TTLL13PA6NNM8 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TTLL13PA6NNM8 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TTLL13PA6NNM8 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TTLL13PA6NNM8 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TTLL13PA6NNM8 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TTLL13PA6NNM8 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TTLL13PA6NNM8 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TTLL13PA6NNM8 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TTLL13PA6NNM8 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TTLL13PA6NNM8 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TTLL13PA6NNM8 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TTLL13PA6NNM8 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TTLL13PA6NNM8 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TTLL13PA6NNM8 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TTLL13PA6NNM8 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TTLL13PA6NNM8 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TTLL13PA6NNM8 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TTLL13PA6NNM8 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TTLL13PA6NNM8 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TTLL13PA6NNM8 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TTLL13PA6NNM8 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TTLL13PA6NNM8 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TTLL13PA6NNM8 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TTLL13PA6NNM8 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TTLL13PA6NNM8 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TTLL13PA6NNM8 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms