Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ARL2-SNX15V9GYD0 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ARL2-SNX15V9GYD0 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ARL2-SNX15V9GYD0 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ARL2-SNX15V9GYD0 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ARL2-SNX15V9GYD0 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ARL2-SNX15V9GYD0 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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ARL2-SNX15V9GYD0 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ARL2-SNX15V9GYD0 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ARL2-SNX15V9GYD0 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ARL2-SNX15V9GYD0 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
ARL2-SNX15V9GYD0 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
ARL2-SNX15V9GYD0 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ARL2-SNX15V9GYD0 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ARL2-SNX15V9GYD0 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ARL2-SNX15V9GYD0 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ARL2-SNX15V9GYD0 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ARL2-SNX15V9GYD0 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ARL2-SNX15V9GYD0 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ARL2-SNX15V9GYD0 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ARL2-SNX15V9GYD0 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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ARL2-SNX15V9GYD0 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ARL2-SNX15V9GYD0 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ARL2-SNX15V9GYD0 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
ARL2-SNX15V9GYD0 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ARL2-SNX15V9GYD0 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ARL2-SNX15V9GYD0 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ARL2-SNX15V9GYD0 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ARL2-SNX15V9GYD0 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ARL2-SNX15V9GYD0 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ARL2-SNX15V9GYD0 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
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ARL2-SNX15V9GYD0 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ARL2-SNX15V9GYD0 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ARL2-SNX15V9GYD0 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ARL2-SNX15V9GYD0 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
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ARL2-SNX15V9GYD0 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ARL2-SNX15V9GYD0 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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ARL2-SNX15V9GYD0 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ARL2-SNX15V9GYD0 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ARL2-SNX15V9GYD0 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ARL2-SNX15V9GYD0 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ARL2-SNX15V9GYD0 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ARL2-SNX15V9GYD0 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ARL2-SNX15V9GYD0 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ARL2-SNX15V9GYD0 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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ARL2-SNX15V9GYD0 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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ARL2-SNX15V9GYD0 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ARL2-SNX15V9GYD0 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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ARL2-SNX15V9GYD0 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ARL2-SNX15V9GYD0 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ARL2-SNX15V9GYD0 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
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ARL2-SNX15V9GYD0 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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ARL2-SNX15V9GYD0 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ARL2-SNX15V9GYD0 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ARL2-SNX15V9GYD0 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ARL2-SNX15V9GYD0 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ARL2-SNX15V9GYD0 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ARL2-SNX15V9GYD0 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ARL2-SNX15V9GYD0 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ARL2-SNX15V9GYD0 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ARL2-SNX15V9GYD0 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ARL2-SNX15V9GYD0 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ARL2-SNX15V9GYD0 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
ARL2-SNX15V9GYD0 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ARL2-SNX15V9GYD0 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ARL2-SNX15V9GYD0 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ARL2-SNX15V9GYD0 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
ARL2-SNX15V9GYD0 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
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