Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3F1

Putative TAP2-associated 6.5 kDa polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9Y3F1 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q9Y3F1 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q9Y3F1 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q9Y3F1 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q9Y3F1 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q9Y3F1 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q9Y3F1 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q9Y3F1 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q9Y3F1 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q9Y3F1 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q9Y3F1 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q9Y3F1 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q9Y3F1 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q9Y3F1 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q9Y3F1 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q9Y3F1 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q9Y3F1 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q9Y3F1 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Q9Y3F1 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q9Y3F1 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q9Y3F1 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q9Y3F1 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q9Y3F1 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q9Y3F1 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9Y3F1 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9Y3F1 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9Y3F1 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9Y3F1 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9Y3F1 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9Y3F1 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9Y3F1 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9Y3F1 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9Y3F1 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9Y3F1 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9Y3F1 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9Y3F1 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9Y3F1 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9Y3F1 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9Y3F1 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9Y3F1 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9Y3F1 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9Y3F1 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9Y3F1 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9Y3F1 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9Y3F1 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9Y3F1 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9Y3F1 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9Y3F1 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9Y3F1 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9Y3F1 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9Y3F1 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9Y3F1 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9Y3F1 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9Y3F1 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9Y3F1 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9Y3F1 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9Y3F1 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9Y3F1 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9Y3F1 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9Y3F1 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q9Y3F1 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q9Y3F1 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q9Y3F1 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q9Y3F1 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q9Y3F1 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q9Y3F1 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q9Y3F1 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q9Y3F1 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q9Y3F1 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q9Y3F1 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q9Y3F1 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q9Y3F1 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Q9Y3F1 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q9Y3F1 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q9Y3F1 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q9Y3F1 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Q9Y3F1 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q9Y3F1 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Q9Y3F1 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q9Y3F1 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q9Y3F1 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q9Y3F1 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Q9Y3F1 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q9Y3F1 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Q9Y3F1 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Q9Y3F1 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q9Y3F1 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Q9Y3F1 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q9Y3F1 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q9Y3F1 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q9Y3F1 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q9Y3F1 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q9Y3F1 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q9Y3F1 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q9Y3F1 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q9Y3F1 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q9Y3F1 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q9Y3F1 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q9Y3F1 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q9Y3F1 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms