Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y366

IFT52, Intraflagellar transport protein 52 homolog, humanhuman

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Length 437 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT52Q9Y366 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFT52Q9Y366 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFT52Q9Y366 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFT52Q9Y366 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
IFT52Q9Y366 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFT52Q9Y366 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
IFT52Q9Y366 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFT52Q9Y366 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFT52Q9Y366 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFT52Q9Y366 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFT52Q9Y366 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFT52Q9Y366 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFT52Q9Y366 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFT52Q9Y366 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFT52Q9Y366 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFT52Q9Y366 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFT52Q9Y366 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFT52Q9Y366 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFT52Q9Y366 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFT52Q9Y366 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFT52Q9Y366 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFT52Q9Y366 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFT52Q9Y366 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFT52Q9Y366 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFT52Q9Y366 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFT52Q9Y366 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFT52Q9Y366 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFT52Q9Y366 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFT52Q9Y366 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFT52Q9Y366 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFT52Q9Y366 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
IFT52Q9Y366 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFT52Q9Y366 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFT52Q9Y366 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFT52Q9Y366 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
IFT52Q9Y366 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFT52Q9Y366 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFT52Q9Y366 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFT52Q9Y366 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFT52Q9Y366 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFT52Q9Y366 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFT52Q9Y366 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFT52Q9Y366 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFT52Q9Y366 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFT52Q9Y366 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFT52Q9Y366 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFT52Q9Y366 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
IFT52Q9Y366 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFT52Q9Y366 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFT52Q9Y366 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFT52Q9Y366 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFT52Q9Y366 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFT52Q9Y366 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFT52Q9Y366 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFT52Q9Y366 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFT52Q9Y366 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFT52Q9Y366 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFT52Q9Y366 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFT52Q9Y366 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFT52Q9Y366 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFT52Q9Y366 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFT52Q9Y366 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFT52Q9Y366 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFT52Q9Y366 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFT52Q9Y366 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFT52Q9Y366 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFT52Q9Y366 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFT52Q9Y366 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFT52Q9Y366 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFT52Q9Y366 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFT52Q9Y366 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFT52Q9Y366 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFT52Q9Y366 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFT52Q9Y366 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFT52Q9Y366 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFT52Q9Y366 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFT52Q9Y366 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFT52Q9Y366 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFT52Q9Y366 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFT52Q9Y366 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFT52Q9Y366 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFT52Q9Y366 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFT52Q9Y366 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFT52Q9Y366 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFT52Q9Y366 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFT52Q9Y366 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
IFT52Q9Y366 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFT52Q9Y366 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
IFT52Q9Y366 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFT52Q9Y366 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFT52Q9Y366 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFT52Q9Y366 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFT52Q9Y366 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFT52Q9Y366 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFT52Q9Y366 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFT52Q9Y366 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFT52Q9Y366 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IFT52Q9Y366 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
IFT52Q9Y366 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
IFT52Q9Y366 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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