Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y296

TRAPPC4, Trafficking protein particle complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC4Q9Y296 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAPPC4Q9Y296 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAPPC4Q9Y296 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAPPC4Q9Y296 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAPPC4Q9Y296 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAPPC4Q9Y296 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAPPC4Q9Y296 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAPPC4Q9Y296 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAPPC4Q9Y296 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAPPC4Q9Y296 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAPPC4Q9Y296 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAPPC4Q9Y296 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAPPC4Q9Y296 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAPPC4Q9Y296 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAPPC4Q9Y296 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAPPC4Q9Y296 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAPPC4Q9Y296 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAPPC4Q9Y296 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAPPC4Q9Y296 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAPPC4Q9Y296 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TRAPPC4Q9Y296 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TRAPPC4Q9Y296 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TRAPPC4Q9Y296 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TRAPPC4Q9Y296 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TRAPPC4Q9Y296 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TRAPPC4Q9Y296 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TRAPPC4Q9Y296 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
TRAPPC4Q9Y296 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms