Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y256

RCE1, CAAX prenyl protease 2, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCE1Q9Y256 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms